一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬個(gè)基因位點(diǎn)，檢出率和檢測準(zhǔn)確率超99%，技術(shù)達(dá)國際先進(jìn)水平……12日在第三十屆中國北京種業(yè)大會上，荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發(fā)布，標(biāo)志著我國荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設(shè)計(jì)開發(fā)取得重要突破。

荷斯坦牛是當(dāng)前世界奶牛的主要品種，作為單胎大型動物，選擇出優(yōu)秀種公牛是奶牛育種的核心工作。

近年來，國際上已進(jìn)入奶牛基因組選擇育種時(shí)代，使用中高密度育種芯片，能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年，育種效率顯著提升。

第三十屆中國北京種業(yè)大會上展出的荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片。新華社記者丁靜 攝

“十四五”國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目首席科學(xué)家、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授孫東曉說，我國近年來加速構(gòu)建和優(yōu)化奶牛基因組選擇育種技術(shù)平臺，但過去完全依賴國外育種芯片，國內(nèi)種牛檢測樣品需要送到國外實(shí)驗(yàn)室檢測，存在技術(shù)“卡點(diǎn)”及生物信息安全風(fēng)險(xiǎn)。

2020年，首農(nóng)食品集團(tuán)北京奶牛中心、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、華智生物技術(shù)有限公司啟動荷斯坦牛育種芯片自主開發(fā)聯(lián)合攻關(guān)，基于過去多年的科研成果，挖掘、鑒定了一批針對我國荷斯坦牛群體遺傳背景的基因位點(diǎn)，自主設(shè)計(jì)了涵蓋超12萬個(gè)位點(diǎn)（即126K）的育種芯片，可通過牛的毛發(fā)或血液等，檢出基因突變位點(diǎn)、遺傳缺陷位點(diǎn)、親子鑒定位點(diǎn)、其他多組學(xué)來源數(shù)據(jù)位點(diǎn)等。

近日，專家組論證認(rèn)為，芯片設(shè)計(jì)科學(xué)合理，驗(yàn)證程序完善，參照國際同類產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)，達(dá)到產(chǎn)業(yè)化推廣應(yīng)用水平，可用于荷斯坦牛基因組選擇參考群體的構(gòu)建及種牛評價(jià)。

“這是我國荷斯坦牛育種領(lǐng)域首款中高密度育種芯片，對提升我國種公牛自主培育能力和水平，進(jìn)一步完善奶牛種質(zhì)自主評價(jià)體系具有重要意義。”中國奶業(yè)協(xié)會副秘書長陳紹祜說。

中國奶業(yè)協(xié)會育種專業(yè)委員會主任麻柱說，奶牛育種自主創(chuàng)新聯(lián)盟將率先用上這款芯片，助力保障我國奶牛自主選育體系穩(wěn)定運(yùn)行，維護(hù)生物信息安全。